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国家杰出青年科学基金项目“鱼类遗传学与遗传育种”（2023-2027）（32225049）
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国家自然科学基金联合基金项目“大黄鱼刺激隐核虫抗性性状的遗传解析及抗虫育种分子基础研究”（2022-2025）（U21A20264）
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国家重点研发计划-政府间国际科技创新合作重点专项“鲤异源四倍体的性别决定基因鉴定及功能分化研究”（2020-2023）（2019YFE0119000）
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中国-波兰科技人员交流项目“鲤疱疹病毒抗性的遗传基础解析”（2021-2022）
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国家自然科学基金面上项目“极端碱性环境中硬骨鱼类碳酸酐酶基因的适应性进化和遗传机制研究”（2019-2022）（31872561）
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广东省自然科学基金面上项目“中国花鲈南北方群体本土适应性的表观调控机制研究”（2019-2022）（2019A1515010731）
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福建省科技计划高校产学合作项目“大黄鱼抗刺激隐核虫新品系选育应用”（2019-2022）（2019N5001）
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大黄鱼育种国家重点实验室自研项目“基于第三代测序技术的大黄鱼基因组全面解析”（2018-2020）（LYC2017ZY01）
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深圳市知识创新计划基础研究项目“中国花鲈南北群体分化和温度适应性的遗传基础解析”（2018-2020）（JCYJ20170818142601870）
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东方鲀种业创新与产业化工程“东方鲀基因组资源库建设与开发应用”（2017-2020）（2017FJSCZY03）
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厦门大学校长基金“中国沿海花鲈种质资源采集和种群遗传学分析”（2016-2018）（20720160110)）
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国家自然科学基金优秀青年科学基金项目“鱼类基因组学和遗传育种”（2015-2017）（31422057）
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中国水产科学研究院基本科研业务费课题“瓦氏雅罗鱼对高碱环境的适应性分子机制研究”（2014-2016）（2014A03YQ01）
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国家高技术研究发展计划（863计划）“鲤鱼等功能基因组资源开发及其数据库与网站构建”（2011-2015）（2011AA100401）
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国家自然科学基金青年基金项目“基于转录组学的瓦氏雅罗鱼高碱适应机制研究”（2012-2014）（31101893）
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农业部948项目“高信息含量指纹图谱技术的引进和在鲤物理图谱构建中的应用”（2010）（2010Z11）
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国家公益性行业(农业)科研专项“水产分子育种共性技术的建立与应用”之“鲤鲫分子标记和基因高通量开发应用及分子育种数据库与网络平台构建”课题（2009-2013）
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国家高技术研究发展计划（863计划）“品质优良的转基因鲤与转基因唐鱼的品种培育”（2009-2011）（2009AA10Z105）
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中央级公益性科研院所基本科研业务费专项“基于细菌人工染色体的鲤鱼基因组学研究”（2009-2011）
