国家自然科学基金国际及地区交流项目“九龙江流域-河口-近海系统耦合变得及环境生态效应 ” (2009-2012)
	国家自然科学基金重点项目“台湾海峡上升流区浮游植物对海洋环境年际变动的响应” (2004-2007)
	国家自然科学基金对外交流与合作项目“台湾海峡上升流区生态动力学模型研究” (2005-2007)
	国家基金面上项目“生物标记物法研究痕量有机污染物对养殖鱼类的毒理学效应” (2001-2003)
	科技部国际科技合作重点项目计划“中国近海典型赤潮生物营养代谢的分子机制” (2006-2009)
	十一五国家863计划子项目“区域性海洋监测系统技术”福建示范区项目之“海上突发事故应急辅助决策系统” (2007-2010)
	十五国家863计划子项目"台湾海峡及毗邻海域海洋动力环境实时立体监测系统"福建示范区之子项目(2004-2007)
	国家973项目子课题“我国典型赤潮高发区重要赤潮生物对营养物质的生理生态反应” (2002-2006)
	福建省科技厅重点项目“流域－河口－近海系统水环境模型组及其耦合技术研究” (2010-2013)
	福建省重大专项“福建省重点流域水环境综合管理科技支撑项目”(2011-2013)
	福建省科技重大项目“九龙江流域农业非点源污染控制研究” (2002-2004)
	厦门市重大项目“厦门九龙江北溪江东库区饮水源安全保障科技支撑” (2009-2012)