1、国家自然科学基金，41776143，性选择对中华乌塘鳢杂交带形成与维持的作用机制研究，84万，2018/01-2021/12，在研，主持
2、厦门市其他局（委）科技项目，17GYY008NF04，基于养殖海绵活性天然物相关功能产品的研发，208.19万，2017/06-2020/06，在研，主持
3、科技部科技基础条件平台建设计划，2016FY110700，我国重要渔业生物DNA条形码信息采集及其数据库构建，90万元，2013/6-2018/06，在研，主持
4、厦门市其他局（委）科技项目，12PYY001SF08-XMDX-1，海洋药源生物种质资源库建设，42万，2016/03-2016/12，已结题，主持
5、横向项目，XDHT2015612A，海洋药源生物分类鉴定与种质评估，14万，2016/1-2017/11，在研，主持
6、横向项目，XDHT2016520A，浙江沿海常见牡蛎物种鉴定，9.6万，2016/11-2017/11，已结题，主持
7、国家自然科学基金，31540062，社会行为调控海葵鱼性别分化的分子机制研究，18万，2016/01-2016/12，已结题，主持
8、国家海洋局海洋公益性项目，201205024-02，几种重要海洋药用生物种质资源发掘、保藏和利用-海洋药用生物优良种质评价和筛选，366万元，2013/1-2015/12，已结题，主持
9、国家自然科学基金，40976094，三种滩涂穴居鱼类生物地理学与群体遗传学及谱系生物地理学研究，2010/1-2012/12，48万元，结题，主持
