2006年度国家环境保护科学技术奖三等奖，九龙江流域水污染和生态破坏综合整治绩效评估
2013年入选教育部新世纪优秀人才支持计划
2016年获福建省优秀硕士论文（20152039）（作者吴殷琪，导师陈能汪），亚热带暴雨事件九龙江营养盐输出过程与河口响应
2018年获福建省硕士研究生导师团队
2024年入选福建省高层次人才（B类）
2024年获福建省优秀博士论文（20152039）（作者王芬芳，导师陈能汪），红树林-盐沼-河口系统氮源汇、关键过程及其调控机制
